CD69分子为II型膜糖蛋白作为二硫化物结合的同源二聚体表达。人和小鼠的CD69基因编码在NK基因复合体内分别位于染色体12和6中。CD69蛋白未表达在静止的外周血液淋巴细胞中，但出现在最早期活化的淋巴细胞抗原中。据报道CD69抗原的抗体活化T细胞和B细胞，NK细胞、血小板和中性粒细胞，显示CD69蛋白有担当信号分子的作用。CD69蛋白广泛地表达在造血细胞，包括淋巴细胞，中性粒细胞、嗜酸性细胞，血小板与上皮的郎汗氏细胞。CD69还表达在CD4和CD8阳性的胸腺细胞，生发中心T细胞和炎症区域的T细胞。